Rédaction Médicale et Scientifique

Le NEJM a 200 ans ! Bon anniversaire

Le numéro du 5 janvier 2012 du New England Journal of Medicine contient des articles pour célébrer le 200^ème anniversaire...  et toutes les archives sont en ligne...Tout d'abord un site dédié à cet anniversaire liste toutes les découvertes majeures publiées dans le NEJM...  impressionnant et amusant. Des interviews des rédacteurs. Vous pouvez voter pour l'article le plus important plublié par le NEJM...

PLoS ONE publie 70 articles par jour : l'écosystème OA !

C'est un éditorial d'autocongratulation qui a été publié dans PLoS Biology de décembre 2011 pour fêter les 5 ans de PLoS ONE et surtout l'écosystème Open Access (OA). PLoS ONE est qualifié de "megajournal" avec 14 500 articles publiés en 2011.. soit 1 article sur 60 indexés dans PubMed... Mais je reste dubitatif devant cette inondation :  Comment distinguer les bons des mauvais articles ? Comment croire qu'un taux d'acceptation de 70 % est un critère de qualité ?

Les journaux biomédicaux européens bientôt meilleurs que les américains

 Bonne nouvelle qui n'est pas étonnante : c'est une étude sur le facteur d'impact (FI) des journaux de rhumatologie qui apporte des arguments. Cet article écrit par des auteurs de Pékin (Chine) et Groningen (Hollande) a analysé les FI de 10 années (1999-2008). Les FI des journaux européens progressent plus vite que ceux des journaux américains. Les FI des journaux de revues générales progressent plus vite (normal car les revues générales sont beaucoup citées).

Avec 400 rétractations d'articles, 2011 bat des records

 En cette fin d'année, plusieurs journaux et blogs ont fait le listing des malveillances scientifiques de l'année 2011. Ivan Oransky suit les rétractations sur son blog et il en a listé plus de 400 (dans PubMed, il y en a moins de 300 par an). Quelques fraudes ont été importantes : Joachim Boldt (89 rétractations) à Heidelberg (Allemangne), Diederick Stapel, un psyclologue Hollandais (30 rétractations pour l'instant), et la rétractation d'un article de Science de 2009 proposant un lien entre le syndrome de fatigue chronique et un retrovirus murin. Cet article, cité plus de 200 fois, a été très controversé, et Judy Mikovits, qui n'a pas accepté de transmettre les données originales, attend son procès. The Scientist publie la liste des 10 scandales 2011... Live Science publie sa liste aussi... Je ne suis pas convaincu qu'il y ait plus de fraudes, mais je pense qu'il y a plus de transparence et que l'on demande aux scientifiques d'ouvrir leurs données.... Pour Ivan Oransky, son record de commentaires a été battu à propos d'un éditorial de Surgery News . Le rédacteur en chef, Lazar Greenfield, a été démis de ses fonctions de rédacteur. L'éditorial expliquait que pour la St Valentin, il valait mieux offrir du sperme que des chocolats....  Vous pouvez lire l'histoire sur le blog Retraction Watch.....

L'année 2011 vue du Lancet, de Science, avec de belles photos

Le dernier numéro du Lancet contient un article avec 10 photos de médecins, et un article sur les points forts de 2011.

Les 10 photos illustrent l'attractivité du Lancet pour la santé 'globale', pour les problématiques des pays en voie de développement. J'ai choisi ci-contre des jumeaux dans un hôpital en Tanzanie.

Les points majeurs 2011 pour The Lancet ont été :

SPEPS : bravo pour les prix éditoriaux 2011

Le Syndicat de la Presse et des Editions de Santé, ou SPEPS, a comme chaque année remis des prix aux meilleurs articles français. Le SPEPS regroupe environ 400 publications françaises. Cette année le prix était présidé par Gérard de Pouvourville, ESSEC, et j'étais l'un des membres de ce jury. Le SPEPS a préparé un diaporama avec les photos des lauréats, et vous pouvez accéder à tous les articles primés à partir du site du SPEPS. Photo : à gauche, Alain Trébucq, président du SPEPS, et à droite Gérard de Pouvourville.

Une naissance avec un français dans le comité de rédaction

Tous les jours des journaux meurent, mais d'autres naissent. "Health Information Science and Systems" est un nouveau journal du groupe BioMedCentral, donc en open access avec des auteurs heureux de payer à l'acceptation !!!

Le rédacteur en chef est un australien, et le comité de rédaction très international...  c'est avec bonheur que j'ai vu qu'un français était parmi les membres de ce comité : il s'agit du Pr Stéphan Darmoni, du CHU de Rouen. Félicitons le car c'est une reconnaissance méritée. Stéfan Darmoni est le père de CiSMEeF : BRAVO. Cette équipe publie beaucoup : BRAVO. Le comité de rédaction est très asiatique, avec peu d'européens...

Ce journal attend vos articles, et 1195 € lors de l'acceptation... Mais Stéphan Darmoni doit pouvoir nous aider à obtenir un discount majeur.... et aussi pour accepter nos articles....  car en octobre 2011, il n'y a aucun article.

Guide de rédaction AACC : bravo

L'American Association of Clinical Chemistry vient de mettre en ligne son guide de rédaction, en septembre 2011. Vous avez accès gratuit à tous les chapitres : c'est une compilation des 14 articles publiés en 2010 et 2011. J'ai survolé tous ces articles, et j'ai surtout aimé les exemples et exercices... Bien fait pour tout auteur d'un article scientifique. Le chapitre 6 explique bien les nuances entre les formats IRDAM et IMRAD.. Les chapitres 7 à 9 sont sur les illustrations. Certains chapitres sont en espagnol et/ou en chinois....  Et les titres des chapitres sont drôles, regardez :

Minerva ? Un quizz étonnant.... et bravo les auteurs français

J'aime bien cette rubrique hebdomadaire du BMJ que je ne vous ai jamais présentée. Je la lis épisodiquement : sur une page, il y a une dizaine de news qui reprennent en 2 ou 3 phrases les données de quelques articles bien choisis.  Vous trouverez ci-joint Minerva du 8 octobre 2011 car 2 contributions françaises y sont mentionnées :

•         un article de BMC Public Health d'août 2011 sur les accidents de la route des cyclistes en France, par une équipe de Lyon : accidents en ville sont moins graves qu'à la campagne, les jambes plus souvent touchées que les têtes, etc...
•          et surtout un court quizz (image de gauche) des néphrologues de Bichat : intéressant.....

Je remercie François  Vrtovsnik, co-auteur du quizz, qui a accepté de me raconter : "Nous avons d'abord soumis le néphroquizz au Lancet, qui l'a refusé. La réponse du BMJ a été très très rapide (soumis le 22 juin à 13h41, accepté à 15h51 le jour même, l'heure des mails faisant foi !). Le cas n'a pas été réécrit ni modifié. Le consentement du patient était demandé pour le Lancet; nous lui avons redemandé sa signature pour le BMJ." 

 

Un français a un prix Ig Nobel, et attention à la contraception avec Coca-Cola

C'est le dernier numéro du BMJ (8 octobre) qui vient d'attirer mon attention sur la cérémonie de remise des prix Ig Nobel à Harvard : un français, Pr Philippe Perrin, physiologiste et ORL, de Nancy a eu le prix de physique : BRAVO, BRAVO. Avec son équipe, ils ont déterminé pourquoi les lanceurs de disque sont atteints de vertige, mais pas les lanceurs de marteau. Les détails étaient dans le Figaro de fin septembre, et je n'avais pas vu...

La qualité des articles sur les essais de bioéquivalence est mauvaise

Chaque fois qu'une analyse correcte est faite sur un corpus d'articles, c'est la déception : les articles pourraient être améliorés. Félicitons une équipe française de qualité pour ce travail publié dans PLoS ONE en août 2011. Ils ont bien mis leurs méthodes après l'introduction, ce que je préfère, car PLoS ONE a tendance à cacher les méthodes en fin d'article.

Ils ont identifié dans PubMed (janvier 2005 à décembre 2008) 134 articles sur des essais de bioéquivalence comparant un générique à un médicament princeps. Première surprise : 55 articles ont été éliminés car ils ne mentionnaient pas le nom de marque du comparateur, ou le statut éventuellement générique du comparateur. Ceci prouve à l'évidence que les reviewers font très très mal leur travail..... Ensuite ils ont analysés 79 articles et vous devinez les résultats : "The funding source and location of the trial were reported in 41% and 56% of articles, respectively. The type of statistical analysis was reported in 94% of articles, but the methods to generate the randomization sequence and to conceal allocation were reported in only 15% and 5%, respectively. In total, 65 articles of single-dose trials (89%) concluded bioequivalence. Of these, 20 (31%) did not report the 3 criteria within the limits required by the FDA and 11 (17%) did not report the 2 criteria within the limits required by the EMA."

Déprimant NON ? Pourquoi publier ces essais si les publications sont nulles ?

van der Meersch A, Dechartres A, Ravaud P (2011) Quality of Reporting of Bioequivalence Trials Comparing Generic to Brand Name Drugs: A Methodological Systematic Review. PLoS ONE 6(8): e23611. doi:10.1371/journal.pone.0023611

Un prix Nobel fera monter rapidement vos citations

Des Suisses de Zurich ont analysé les 2 millions de citations d'articles de 124 lauréats du prix Nobel (1990-2009) en chimie, physique, médecine et économie. Il s'agit d'un article de PLoS ONE de mai 2011. Je ne sais pas quelle est la qualité de ce travail, car les méthodes sont courtes, et il y a plein d'équations, et de graphes divers...  PLoS ONE n'est pas le meilleur journal....

Ils ont analysés les citations des prix Nobel, et constaté qu'il y avait avant l'attribution du prix un article hautement cité, et que les autres articles précédemment publiés par ces lauréats étaient également beaucoup cités....  Ils créent un "boost factor", et pensent certaienement pouvoir détecter les futurs prix Nobel...   Comme le disait Eugene Garfield qui a créé le facteur d'impact : "grâce à mon facteur d'impact, les jurys peuvent sélectionner les futurs prix Nobel".

Mazloumian A et al. How Citation Boosts Promote Scientific Paradigm Shifts and Nobel Prizes. PLoS ONE 2011;6(5): e18975. doi:10.1371/journal.pone.0018975

La HAS laisse en ligne des recos suspendues BRAVO, BRAVO

Par décision du 19 septembre 2011, la HAS a suspendu 6 recommandations. Nous avions regretté le 6 mai 2011 que la HAS ne laisse pas en ligne des recommandations qui avaient été retirées suite aux remarques du Conseil d'état. Il existe des recommandations de COPE pour dire que les documents abrogés doivent rester en ligne.

Cette fois ci, la HAS applique les bonnes pratiques en matière de gestion des sites et des publications. Nous ne pouvons qu'applaudir en lisant le document ci-dessous, avec une mention en arrière plan de chaque page des documents :

The Wakley prize 2011 du Lancet

The Lancet vient d'annoncer l'ouverture de la compétition annuelle pour ce prix de £ 2000 et la publication dans leur journal d'un essai. Thomas Wakley, fondateur du Lancet en 1823, est le nom retenu pour ce prix donné à un essai sur un sujet libre important pour la santé.

Le prix 2010 a été publié le 26 mars 2011 sur le thème "Health district development and the need to dig deeper"...  vous pouvez écouter le podcast de l'article pour pratiquer votre anglais (13 minutes).

Pour 2012, l'essai devra correspondre aux réflexions qui ont conduit Thomas Wakley à choisir le nom de Lancet qui a 2 significations : "The Lancet would both illuminate, like a lancet window, and “cut out the dross” like a surgical instrument." Rappelons nous que Lancet c'est l'ogive ou le scalpel.

Envoyez votre manuscrit de moins de 2000 mots avant le 11 octobre.

Boyce N et al. Let there be light: the Wakley price 2011. Lancet 2011;378:211.

 

Impressionant dans PLoS Genetics : interview de la Chairman de biologie cellulaire à Harvard

Fêtons le 14 juillet avec cet exemple : en juin 2011, PLoS Genetics publie une longue interview très plaisante d'une française qui est "Chair of Molecular and Cellular Biology at Harvard". Je ne connais pas Catherine Dulac de Montpellier qui parle de la France en bien, qui aime les huitres,..ayant étudié le latin, le grec, l'allemand et le russe.. mais pas l'anglais à l'école. Très belle carrière, pas terminée, mais je note dans l'interview : 
"I love France. The idea of staying in a foreign country was impossible to me. However, there was a problem. I could see from being at Columbia what people after doing a successful post-doc would get: an independent lab, an independent budget, etc. And when I tried to see what I could get in France, it was very clear that all I could get was to go into somebody else's lab with maybe a bench or so. And it made it impossible for me to come back to France right away.   I feel very grateful to my country that gave me what I consider to be an incredibly high quality education. And I feel that we serve our countries, and for me going back to France and being a scientist and teacher in France was my way of giving back. But somehow France wasn't offering me the chance to do so.   It is tough when you go through a PhD and a post-doc with absolutely top science that you are then being asked to forget all of this because you are not given the means to achieve the top level in France."

NO COMMENT

Gitschier J. Vive la différence: an interview with Catherine Dulac. PLoS Genetics 2011;è(6):e1002140

20 000 ème article publié par PLoS ONE

PLoS ONE a anonncé avoir publié son 20 000 ème article... est-ce une bonne nouvelle ?

Richard Smith, ancien rédacteur en chef du BMJ, a souvent utilisé une diapo sur le volume de l'information et la difficulté pour la suivre, en s'inspirant d'une inondation, voire d'un tsunami !

"Water, water everywhere, but there is nothing to drink"

 

Devant tous ces articles, sans savoir lesquels sont bons, je vous conseille de prendre du temps et de faire comme sur la photo !

Prix du BMJ : bravo au Lancet, et à Richard Peto

Le 18 mai 2011, un évènement anglais organisé par le BMJ a consisté à remettre les prix de l'année... grande cérémonie avec 500 personnes, la rédactrice de BMJ, Fiona Godlee, et Hugh Grant... Vous pouvez voir tous les prix sur le site du BMJ. Deux prix méritent mention :

• l'article de l'année a été attribué au groupe CRASH-2 pour un article du Lancet ; rappelons que les 3 articles nomminés avaient été publiés dans le Lancet !
• le prix pour sa carrière au célèbre épidémiologiste Richard Peto.

Les autres prix étaient :

• Getting evidence into practice
• Primary care team of the year
• Secondary care team of the year
• Medical team in a crisis zone
• Junior doctor of the year
• Best improvement in quality and safety
• Innovation in health care
• Health communicator of the year
• Excellence in healthcare education
• Clinical leadership
• Sustainable healthcare

Publiez vos poèmes dans un journal à haut facteur d'impact !

C'est un poème intitulé 'Père Lachaise' dans le CMAJ d'avril 2011 qui a attiré mon attention.... D'accès payant ! On lit : "Jim is here      And Fréderic too......"

• Des journaux biomédicaux publient des poèmes, dont les auteurs sont des médecins. Par exemple, les Annals of Internal Medicine ont des instructions aux auteurs pour les poèmes, avec un maximum de 80 lignes, pas de résumé... 
• Pour le JAMA : "Poems related to the medical experience, whether from the point of view of a health care worker or patient, or simply an observer, will be considered. Poems should be original, not previously published or under consideration elsewhere, and no longer than 50 lines. Authors may submit multiple poems to JAMA simultaneously".
• Les instructions du CMAJ dans ce domaine sont : "We welcome unsolicited poetry, fiction and creatitve nonfiction and especially value contributions that convey personal and professional experiences with a sense of immediacy and realism. The writing should be candid, but patient confidentiality must be respected. In general, prose manuscripts should be limited to 1000 words and poems to no more than 75 lines."

Amis poètes, à vos écritoires et ramenez quelques points SIGAPS....

Poppe A. Père Lachaise CMAJ 2011;183(6):E354.

Research4Life : HINARI, AGORA, OARE pour offrir le savoir aux PVD

Nous avons plusieurs fois évoqué HINARI (Health InterNetwork Access to Research Initiative), ce modèle lancé par l'OMS en 2001 pour assurer un accès gratuit à l'information en santé dans 105 pays en voie de développement (PVD). HINARI, grace à des accords avec 120 maisons d'édition permet de mettre en accès libre plus de 5 500 'peer-reviewed journals' du domaine de la santé. Dans nos derniers billets, nous avons évoqué la tentative de maisons d'éditions de couper les accès quand les consultations dans un pays (en occurence Bangladesh) augmentaient et pourraient générer des recettes... mais la communauté internationale s'est mobilisée en faveur des PVD.

Deux autres réseaux existent :

AGORA (Access to Global Online Research in Agriculture) qui met en accès libre plus de 1200 journaux du domaine de l'agriculture, sous l'égide de la FAO ; AORE (Online Access to Research in the Environment) qui met en accès libre plus de 2000 journaux dans le domaine de l'environnement, sous l'égide de UNEP.

Ces 3 initiatives sont regroupées dans un mouvement Research4life dont l'objectif est de contribuer à 6 des 8 objectifs du millénaire de l'ONU, et supportées par : "Over 150 publishers are contributing content to Research4Life. Other partners include Cornell University Yale University, the International Association of Scientific Technical and Medical Publishers, Microsoft, and donor agencies including the UK Department for International Development, John D. and Catherine T. MacArthur Foundation, William and Flora Hewlett Foundation, and the Rockefeller Foundation".

Médecine factuelle : enseignement obligatoire !

Ce n'est pas un gag, mais une réalité en Belgique...   Qui nous laisse espérer qu'un jour ce sera obligatoire en France pour tous les médecins en fin détude. Cet enseignement a un lien fort avec les journaux et les très rares bons articles. Lles revues systématiques et narratives ont été bien expliquées (avec les critères de l'article fondateur de C Mulrow en 1987 dans les Annals... à relire), les niveaux de preuve (avec la grille de l'ANAES en 2000), les recommandations de pratique clinique, etc...   

Toutes les diapos du cours des 4 et 5 mars 2011 à Bruxelles ont été mises en ligne et vous pouvez les télécharger (aller sur médecine factuelle puis année académique 2010-2011). La plupart des présentations sont très très riches en citations, et je retiens la recherche documentaire (rejetez google et pensez Zotero..) ainsi que la présentations sur les conflits d'intérêts (avec des reprises d'un article classique du NEJM sur les antidépresseurs..)... Donc plein de bonnes idées..